《男子游泳部 第一季》这部动漫讲述了一群少年在游泳比赛中追求梦想、坚持友情的故事。在小学时期，游泳部的四名成员曾在毕业前的游泳比赛中获得了冠军，但之后他们各自毕业，分别走向了不同的道路。然而，时过境迁，七濑遥和好友橘真琴升上高中后，与昔日游泳部的成员之一叶月渚重逢。回忆过去的美好时光，他们决定一同前往曾经的游泳馆。在那里，他们意外地遇见了曾离国留学的松冈凛。不料，昔日的战友凛却变得性情大变，还向遥发起挑战，结果遥竟然输给了他。